En septiembre de 2005, surgió la segunda entrega de la versión deportiva RS, disponible en las dos carrocerías. La versión turboalimentada de gasolina de 200 CV se complementó con un motor turbodiésel de 170 CV, en agosto de 2006.

A principios de 2009, el Octavia RS se sometió a una actualización estética, tanto en la carrocería como en el habitáculo (foto).